醫療污水除專業功能部門產生的部分特殊污水外，基本屬性與生活污水相似，甚至COD、BOD等主要污染屬性略低于生活污水。但相對于生活污水，在檢 驗、分析、中會產生少量的特殊性質的污水，主要包括酸性污水、含污水、含重金屬污水、洗印污水、放射性污水等。

海南醫療污水處理系統主要由一級沉淀消毒處理和二級生化消毒處理工藝。醫療污水處理設備具體處理工藝可依據出水要求進行選擇。當處理廢水可排入城市污水管網時，選用一級處理，要求直接排放時，選用二級處理工藝。當選用一級處理流程時，醫院污水應與員工生活區污水、雨水分流，僅對醫院污水進行消毒處理；當選用二級或深度處理流程時，依據需要，員工生活區污水可與醫院污水河流進行處理，但廚房用水有必要設隔油井（池）。醫療污水處理設備依據醫院污水的特色，一般選用先進老練的“厭氧水解+生物觸摸氧化+消毒”的工藝。

海南醫療污水處理系統曝氣生物濾池由內錐即下向流對流接觸氧化區和外錐即上向流曝氣生物過濾區，以及下部導流沉降無泵污泥回流區三部分組成。
在內錐即下向流生物接觸氧化過濾區和外錐即上向流曝氣生物過濾區內，都設有濾料。在下部的導流沉降分離無泵污泥回流區內裝有導流板和無泵污泥回流管。在內錐即下向流對流接觸氧化生物過濾區和外錐即上向流曝氣生物過濾區，與下部的導流沉降分離無泵污泥自動回流區之間裝有濾料，并在濾料下部設有濾池反沖洗空氣管和水管。其污水流向為：污水自上而下進入內錐即下向流對流接觸氧化生物過濾區內，通過濾料空隙間曲折下行至導流沉降無泵污泥回流區，實現泥水分離，分離出來的污泥在不用泵的條件下，自動回流到污水池的前端，進入厭氧池或水解酸化池反硝化處理。分離出來的水導入外錐即上向流曝氣生物過濾區，并同樣通過濾料空隙曲折上升，污水在上升的處理過程中產生的污泥也在重力作用下，自動下沉于導流沉降分離區，通過無泵污泥排泥系統，回流到污水池前端進入厭氧池或水解酸化池反硝化處理。